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螞蟻與相思樹的共生關係中年齡依賴的防禦機制之發育與演化
相思樹提供庇護與蜜腺豢養兇猛的螞蟻軍團,減少被其他動物啃食的機率。這個互利共生的防禦機制在植株成長到一定程度後才會啟動,其中年齡依賴的因素在分子機制上與 miR156/miR157-SPL 的營養生長階段轉換途徑 (vegetative-phase change pathway) 有著緊密的關聯。
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相思樹提供庇護與蜜腺豢養兇猛的螞蟻軍團,減少被其他動物啃食的機率。這個互利共生的防禦機制在植株成長到一定程度後才會啟動,其中年齡依賴的因素在分子機制上與 miR156/miR157-SPL 的營養生長階段轉換途徑 (vegetative-phase change pathway) 有著緊密的關聯。
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異染色質絲 (Heterochromatin) 抑制轉位子表達與調節細胞核結構。在人類與果蠅的細胞中,由異染色質絲蛋白質 (Heterochromatin Protein 1, HP1) 辨識 H3 lysine 9 trimethylation (H3K9me3),與其他蛋白質共同維持異染色質絲的功能,並參與相位分離 (phase separation)。但是植物中的同源基因 Like Heterochromatin Protein 1 (LHP1) 功能不同,研究團隊鎖定了與 HP1 同樣具有 Agenet domain 的 Agenet Domain Containing Protein 1 (ADCP1) ,由生化、結構、表現量等不同分析角度展示 ADCP1 在植物中的功能與 HP1 相似。
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轉位子定期的爆發形塑基因體演化,研究團隊手上有四個正在經歷 mPing 轉位子爆發的品系,全面分析了三千多個水稻品系中名為 mPing/Ping/Pong 的轉位子基因家族的拷貝數及其活性,一步步排除不相關的因素,最後篩選出 Ping16A_Stow 在各方面都與轉位子爆發的證據共同存在,至於確切機制則有待未來研究。
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要真的搞懂基因體編輯的最新發展細節與全面的應用非常困難,但是要讓只了解簡單概念的大眾擷取片面說詞來批評卻很容易,這種主題就會很容易淪為某些利益團體的操弄工具。新聞媒體在這方面的報導一定要詳盡與謹慎,對一般民眾來說無關痛癢的學術專有名詞,卻是對於研究事實本質的描述,實際上關乎立法與管制,如果科學用詞都不精確,還要進行科普解釋便會誤導非專業讀者。
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連結作物外表型態與遺傳因子是分子輔助育種的重要步驟,面對多個基因共同控制的數量型性狀,MutMap 結合了化學誘變劑和高通量定序,透過簡單的 SNP index 計算就可以在 F2 的定序結果中取得造成性狀差異的候選 SNP。
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應用農桿菌 T-DNA 插入基因體中的特性使被插入的植物基因失去功能,是被廣泛運用的製造突變株以探索基因功能的研究方式。這篇研究中的突變株在 T-DNA 被插入的位置也丟失了一大段序列,約莫 75.
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